Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms