Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms