Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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PTPRDP23468 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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