Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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RFXAPO00287 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
RFXAPO00287 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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