Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms