Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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ECM1Q16610 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
ECM1Q16610 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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