Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
NCOA4Q13772 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
NCOA4Q13772 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms