Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTP4A2Q12974 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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