Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXO1Q12778 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXO1Q12778 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXO1Q12778 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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FOXO1Q12778 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXO1Q12778 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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FOXO1Q12778 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FOXO1Q12778 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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