Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms