Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms