Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CDKN3Q16667 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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