Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FSCN1Q16658 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms