Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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