Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC211486.5-201ENST00000616609 775 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC024580.1-201ENST00000623020 674 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NSRP1-217ENST00000612959 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 OR2V2-203ENST00000641791 4428 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAMK2BQ13554 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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