Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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IFT88Q13099 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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