Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms