Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SH3BP1Q9Y3L3 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms