Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CIPCQ9C0C6 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CIPCQ9C0C6 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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