Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ZNF548Q8NEK5 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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