Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HMGN3Q15651 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
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HMGN3Q15651 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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