Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms