Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ITGB3BPQ13352 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms