Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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