Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms