Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-1B6SEH8 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-1B6SEH8 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-1B6SEH8 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
ERVV-1B6SEH8 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ERVV-1B6SEH8 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms