Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms