Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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