Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RFTN1Q14699 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms