Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ATP1A4Q13733 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ATP1A4Q13733 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms