Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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