Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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LINC00587B1AMM8 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
LINC00587B1AMM8 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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