Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms