Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP17L8P0C7I0 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms