Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PKHD1P08F94 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKHD1P08F94 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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