Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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COL24A1Q17RW2 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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COL24A1Q17RW2 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
COL24A1Q17RW2 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL24A1Q17RW2 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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