Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CTF1Q16619 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms