Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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ITGB3BPQ13352 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ITGB3BPQ13352 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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ITGB3BPQ13352 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
ITGB3BPQ13352 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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