Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
IRF9Q00978 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms