Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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