Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm17190V9GX38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17190V9GX38 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm17190V9GX38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm17190V9GX38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm17190V9GX38 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gm17190V9GX38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17190V9GX38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms