Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top3bQ9Z321 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top3bQ9Z321 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms