Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Crlf3Q9Z2L7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.2 ms