Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms