Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Syngr4Q9Z1L2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms