Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdh13Q9WTR5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms