Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exo1Q9QZ11 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms