Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcnip3Q9QXT8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Kcnip3Q9QXT8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Kcnip3Q9QXT8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Kcnip3Q9QXT8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Kcnip3Q9QXT8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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