Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Txnrd1Q9JMH6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Txnrd1Q9JMH6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms