Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prg4Q9JM99 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prg4Q9JM99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms